Les orchestres regroupent les élèves de l'ISAAC de niveau "avancé". L'accent est mis sur la mise en autonomie de l'orchestre, une ou plusieurs diffusions sont organisées dans l'année.
L'accès aux orchestres de l'ISAAC nécessite une expérience significative dans le jeu instrumental en orchestre salsa et se fait sur entretien d'orientation pour les élèves 2007-2008 et sur audition pour les nouveaux élèves.